人类基因组的“国际单型作图项目”----HapMap

在人类基因组的30亿个碱基对中，人与人之间在其中的大部分碱基对上都是相同的。但仅仅关注使人与人之间有所不同的30万至60万个关键差异，就已经能使我们识别出一些遗传疾病及其治疗方法了。在单个核苷酸中出现的这些变化经常是成区段出现的，或者说是以单型（haplotype）组的形式出现的。“国际单型作图项目”基于100万个以上的单个变化绘制出了几个地方的人群中的单型图，他们的第一批成果发表在本期Nature上的一篇具有里程碑意义的论文中。本期封面所描绘的是三个地方的人口的基因组中在CFTR（囊性纤维瘤）基因周围的那一部分。从中我们可以看到，在每个地方的人口在其内部所共享的差异区段中（用深颜色表示）以及基因组中在随时间推移变化较多、不是成区段出现的区域中（插入的灰线）有明显的断开。公众可以通过www.hapmap.org这个网站免费获得关于基因组变化的大量资料。（Nature 437: 7063 27 October 2005，Article p. 1299; News and Views p. 1241）

两个人即使有相同的基因，这些基因表达的水平也会对个体之间的差异产生很大影响。一组研究人员以“国际单型作图项目”的数据为基础，利用基因关联绘制出了每个基因上控制基因表达水平的部分的位置图。利用这些数据还可以对基因联系和关联（genetic linkage and association）进行详细比较，二者都被用来确定人类疾病的遗传因素。（Letter p. 1365）

以上内容来自《nature》杂志！

newytht.net来了又走，原来是个骗子！

好久没有关注BBS了，今天想起来newytht，于是赶紧访问一下。却发现www.newytht.net上不去了。Google了一下newytht,不料发现了“骗子”的字眼。再google一下newytht和骗子，有这么一条信息引起了我的注意：

擦亮眼睛:newytht是骗子公司燕园菁华开的
newytht利用ytht的名声，骗了不少人。今天还在北大的一些宿舍楼发广告《新糊涂特刊》，许多人仍旧以为这个网站和ytht有继承关系，而知道这个网站背景的也很少。网站上面没有一点关于主办方的介绍。但无论骗子多么高明，总后露出马脚。经过调查，发现newytht.net的主办方原来是“燕园菁华”这个名声狼藉的骗子公司。希望大家擦亮眼睛，不要被骗！！newytht.net的域名注册留的电话、E-mail均为燕园菁华所有，这足以说明了newwytht.net的来源。希望大家一起声讨骗子公司的恶劣行径，维护ytht的纯洁和神圣！！！
这个帖子更详细。

还有，不知道为什么lqqm.net也上不去了。

懒得blog

这里blog那里也是blog，blog越来越泛滥了。泛滥得让人感觉没有品位。
泛滥/炒作/空洞/利益，让blog变成了一种从众、追求个性反而失去个性的行为。
本来我的blog也不是想通过它来赚钱，也不梦想有一天有人收购。所以一直以来，我的blog上没有任何广告。这也是我选择blogspot的blog服务的原因之一。
我希望我的读者能有一个清新的阅读感觉，能达到这个效果，我也很满足了。
现在实在是忙。忙也有忙的体会，体会了以前不曾体会的人生感觉。
心得笔记：当时间变得珍贵时，想做什么事都变得很奢侈。

用MS Word在blogger上发文章

安装了blogger的word插件，就可以用word写blog了。呵呵，试验一下。Blogger中默认的字号在word中是小四。
实验一下字体的颜色：红色，兰色。 哦，字体的颜色好象不管用。

Blogger的利器，Flock真酷！

听说了flock浏览器,试用了一下,感觉非常好!

这个post就是用flock写的。

Technorati Tags: flock, blogger

多吃健康食品，拒绝垃圾食品，从现在做起！

保鲜膜又出了问题！

电视和网上报道，很多超市用保鲜膜包装的食品大都是用PVC保鲜膜包装的。PVC是聚氯乙烯的缩写，它早就被禁止在食品包装中使用，尤其是在油性食品或加热的时候，释放的毒性更大。而比较健康的保鲜膜是用PE为材料制作的，PE是聚乙烯的缩写。

用PVC为材料的保鲜膜大都是国外品牌在中国生产的，并且都用在超市的食品包装上。而真正超市销售的保鲜膜，尤其是国产的，大都是健康的PE材料的。这就意味着，我们可以放心购买超市的保鲜膜，而要提防超市包装好的保鲜膜食品了。

今天看《参考消息》的健康栏目，里面谈到了很多食品方面的问题。我印象最深的就是，

健康食品包括：

1. 首先，牛奶和酸奶是首选。
2. 蔬菜，强调是新鲜的。
3. 水果。
4. 鱼，每周建议两次。河鱼海鱼都可以，但是海鱼最好！
5. 等等

垃圾食品包括：

1. 油炸食品；
2. 肥肉；
3. 鸡皮、鸭皮；
4. 动物的内脏；
5. 腌制食品、方便面。

健康第一！为了以后的健康，我以后真的要注意了。因为垃圾食品都是我最爱。（我反对吃麦当劳和肯德基，不过和这没有关系。）

神6上天，为什么出名的只有航天员？

神6上天了，两名航天员成了世人关注的焦点。他们的家人、家乡－－甚至一切相关的事物，都成了媒体追逐的对象。而幕后的科技人员还是像神州五号上天的时候一样默默无闻。这引起了很多人的思考。

1. 首先，航天员是吸引了最多的眼球，也是最容易关注的。他们俩是从不知多少个优秀候选人中万里挑一选拔的，素质自然是出众的。
2. 第二，航天员遨游太空，这种非凡的经历没几个人能体验。这方面的特殊也进一步强化了他们所受的关注程度。
3. 第三，上天的航天员只有两个，幕后的支撑人员成千上万。两个人好炒作，千万个人里选谁的好？ 好比当时我国成功合成结晶牛胰岛素，国际上要报诺贝尔奖候选，我们费劲巴力地选了几十个人，这也是不容易地，已经到了去掉都不行的地步。最后人家评奖委员会说，最多只能有3个人分享Nobel，结果只得流产。
4. 第四，媒体炒作有跟风的特点。只要少数主流媒体一起来炒作，其他媒体就是一窝蜂地上。

不过，按照世俗的看法，科研人员好像就应该甘于寂寞。这也与现在的情形吻合了。呵呵。

Tags: 神六 航天员

放弃新浪的vivi，搬家到BlinkList啦。

以前用过365key的网络书签，后来嫌其太乱了，搬家到了新浪的vivi。但是新浪vivi有好几个我不能忍受的缺点：

1. 不支持导入导出；
2. 访问书签是通过新浪的一个莫名其妙的网址，完全看不到原来收藏的URL；
3. vivi首页完全变成了一个色情信息集散地。

顺便提一句，新浪的免费邮件也是很没有信心，不支持邮件的转发。这是新浪没有信心的表现，他不提供搬家的工具，强迫用户使用他们的服务。但是你们的服务不好，即便麻烦一点，用户也会跑的。

前两天听说了BlinkList，去看了看，觉得不错，就决定搬家到那里了。

Tags: 新浪vivi Blinklist

一个新的信号肽数据库：SPdb

Background
The signal peptide plays an important role in protein targeting and protein translocation in both prokaryotic and eukaryotic cells. This transient, short peptide sequence functions like a postal address on an envelope by targeting proteins for secretion or for transfer to specific organelles for further processing. Understanding how signal peptides function is crucial in predicting where proteins are translocated. To support this understanding, we present SPdb signal peptide database (http://proline.bic.nus.edu.sg/spdb), a repository of experimentally determined and computationally predicted signal peptides.

Results
SPdb integrates information from two sources (a) Swiss-Prot protein sequence database which is now part of UniProt and (b) EMBL nucleotide sequence database. The database update is semi-automated with human checking and verification of the data to ensure the correctness of the data stored. The latest release SPdb release 3.2 contains 18,146 entries of which 2,584 entries are experimentally verified signal sequences with annotated references; the remaining 15,562 entries are either signal sequences that fail to meet our filtering criteria or entries that contain unverified or missing signal sequences.

Conclusions
SPdb is a manually curated database constructed to support the understanding and analysis of signal peptides. SPdb tracks the major updates of the two underlying primary databases thereby ensuring that its information remains up-to-date.

BMC Bioinformatics 2005, 6:249 doi:10.1186/1471-2105-6-249
Published 13 October 2005

一个有意思的密码管理方案

这个网站提供一种有意思的密码管理方案，让你在任何可以连上internet的终端，都可以用一个密码管理你的一大堆密码。但是有趣的是，他既不是把密码存储在服务器上，也不是存储在本地硬盘上。那么他是如何作到的呢？你可以去自己看看。http://passwordmaker.org/index.html
都是英文的，我还没有仔细研究明白呢。呵呵。