2005-10-31

一些有用的资源链接

http://www.hubmed.org/
PubMed的另外一个入口;
http://www.scirus.com/srsapp/
文献检索的一个数据库,很全!
http://www.citeulike.org/
在线个人文献存储服务,社会化的!

人类基因组的“国际单型作图项目”----HapMap

在人类基因组的30亿个碱基对中,人与人之间在其中的大部分碱基对上都是相同的。但仅仅关注使人与人之间有所不同的30万至60万个关键差异,就已经能使我们识别出一些遗传疾病及其治疗方法了。在单个核苷酸中出现的这些变化经常是成区段出现的,或者说是以单型(haplotype)组的形式出现的。“国际单型作图项目”基于100万个以上的单个变化绘制出了几个地方的人群中的单型图,他们的第一批成果发表在本期Nature上的一篇具有里程碑意义的论文中。本期封面所描绘的是三个地方的人口的基因组中在CFTR(囊性纤维瘤)基因周围的那一部分。从中我们可以看到,在每个地方的人口在其内部所共享的差异区段中(用深颜色表示)以及基因组中在随时间推移变化较多、不是成区段出现的区域中(插入的灰线)有明显的断开。公众可以通过www.hapmap.org这个网站免费获得关于基因组变化的大量资料。(Nature 437: 7063 27 October 2005,Article p. 1299; News and Views p. 1241

两个人即使有相同的基因,这些基因表达的水平也会对个体之间的差异产生很大影响。一组研究人员以“国际单型作图项目”的数据为基础,利用基因关联绘制出了每个基因上控制基因表达水平的部分的位置图。利用这些数据还可以对基因联系和关联(genetic linkage and association)进行详细比较,二者都被用来确定人类疾病的遗传因素。(Letter p. 1365

以上内容来自《nature》杂志!

2005-10-28

newytht.net来了又走,原来是个骗子!

好久没有关注BBS了,今天想起来newytht,于是赶紧访问一下。却发现www.newytht.net上不去了。Google了一下newytht,不料发现了“骗子”的字眼。再google一下newytht和骗子,有这么一条信息引起了我的注意:

擦亮眼睛:newytht是骗子公司燕园菁华开的
newytht利用ytht的名声,骗了不少人。今天还在北大的一些宿舍楼发广告《新糊涂特刊》,许多人仍旧以为这个网站和ytht有继承关系,而知道这个网站背景的也很少。网站上面没有一点关于主办方的介绍。但无论骗子多么高明,总后露出马脚。经过调查,发现newytht.net的主办方原来是“燕园菁华”这个名声狼藉的骗子公司。希望大家擦亮眼睛,不要被骗!!newytht.net的域名注册留的电话、E-mail均为燕园菁华所有,这足以说明了newwytht.net的来源。希望大家一起声讨骗子公司的恶劣行径,维护ytht的纯洁和神圣!!!
这个帖子更详细

还有,不知道为什么lqqm.net也上不去了。

2005-10-27

懒得blog

这里blog那里也是blog,blog越来越泛滥了。泛滥得让人感觉没有品位。
泛滥/炒作/空洞/利益,让blog变成了一种从众、追求个性反而失去个性的行为。
本来我的blog也不是想通过它来赚钱,也不梦想有一天有人收购。所以一直以来,我的blog上没有任何广告。这也是我选择blogspot的blog服务的原因之一。
我希望我的读者能有一个清新的阅读感觉,能达到这个效果,我也很满足了。
现在实在是忙。忙也有忙的体会,体会了以前不曾体会的人生感觉。
心得笔记当时间变得珍贵时,想做什么事都变得很奢侈。

2005-10-21

用MS Word在blogger上发文章

安装了blogger的word插件,就可以用wordblog了。呵呵,试验一下。Blogger中默认的字号在word中是小四。
实验一下字体的颜色:红色,兰色。 哦,字体的颜色好象不管用。

Blogger的利器,Flock真酷!

听说了flock浏览器,试用了一下,感觉非常好!

这个post就是用flock写的。

Technorati Tags: ,

2005-10-20

多吃健康食品,拒绝垃圾食品,从现在做起!

保鲜膜又出了问题!

电视和网上报道,很多超市用保鲜膜包装的食品大都是用PVC保鲜膜包装的。PVC是聚氯乙烯的缩写,它早就被禁止在食品包装中使用,尤其是在油性食品或加热的时候,释放的毒性更大。而比较健康的保鲜膜是用PE为材料制作的,PE是聚乙烯的缩写。

用PVC为材料的保鲜膜大都是国外品牌在中国生产的,并且都用在超市的食品包装上。而真正超市销售的保鲜膜,尤其是国产的,大都是健康的PE材料的。这就意味着,我们可以放心购买超市的保鲜膜,而要提防超市包装好的保鲜膜食品了。

今天看《参考消息》的健康栏目,里面谈到了很多食品方面的问题。我印象最深的就是,

健康食品包括:

  1. 首先,牛奶和酸奶是首选。
  2. 蔬菜,强调是新鲜的。
  3. 水果。
  4. 鱼,每周建议两次。河鱼海鱼都可以,但是海鱼最好!
  5. 等等

垃圾食品包括:

  1. 油炸食品;
  2. 肥肉;
  3. 鸡皮、鸭皮;
  4. 动物的内脏;
  5. 腌制食品、方便面。

健康第一!为了以后的健康,我以后真的要注意了。因为垃圾食品都是我最爱。(我反对吃麦当劳和肯德基,不过和这没有关系。)

2005-10-19

神6上天,为什么出名的只有航天员?

神6上天了,两名航天员成了世人关注的焦点。他们的家人、家乡--甚至一切相关的事物,都成了媒体追逐的对象。而幕后的科技人员还是像神州五号上天的时候一样默默无闻。这引起了很多人的思考。

  1. 首先,航天员是吸引了最多的眼球,也是最容易关注的。他们俩是从不知多少个优秀候选人中万里挑一选拔的,素质自然是出众的。
  2. 第二,航天员遨游太空,这种非凡的经历没几个人能体验。这方面的特殊也进一步强化了他们所受的关注程度。
  3. 第三,上天的航天员只有两个,幕后的支撑人员成千上万。两个人好炒作,千万个人里选谁的好? 好比当时我国成功合成结晶牛胰岛素,国际上要报诺贝尔奖候选,我们费劲巴力地选了几十个人,这也是不容易地,已经到了去掉都不行的地步。最后人家评奖委员会说,最多只能有3个人分享Nobel,结果只得流产。
  4. 第四,媒体炒作有跟风的特点。只要少数主流媒体一起来炒作,其他媒体就是一窝蜂地上。

不过,按照世俗的看法,科研人员好像就应该甘于寂寞。这也与现在的情形吻合了。呵呵。


2005-10-18

放弃新浪的vivi,搬家到BlinkList啦。

以前用过365key的网络书签,后来嫌其太乱了,搬家到了新浪的vivi。但是新浪vivi有好几个我不能忍受的缺点:

  1. 不支持导入导出;
  2. 访问书签是通过新浪的一个莫名其妙的网址,完全看不到原来收藏的URL;
  3. vivi首页完全变成了一个色情信息集散地。
顺便提一句,新浪的免费邮件也是很没有信心,不支持邮件的转发。这是新浪没有信心的表现,他不提供搬家的工具,强迫用户使用他们的服务。但是你们的服务不好,即便麻烦一点,用户也会跑的。

前两天听说了BlinkList,去看了看,觉得不错,就决定搬家到那里了。

2005-10-17

一个新的信号肽数据库:SPdb

Background
The signal peptide plays an important role in protein targeting and protein translocation in both prokaryotic and eukaryotic cells. This transient, short peptide sequence functions like a postal address on an envelope by targeting proteins for secretion or for transfer to specific organelles for further processing. Understanding how signal peptides function is crucial in predicting where proteins are translocated. To support this understanding, we present SPdb signal peptide database (http://proline.bic.nus.edu.sg/spdb), a repository of experimentally determined and computationally predicted signal peptides.

Results
SPdb integrates information from two sources (a) Swiss-Prot protein sequence database which is now part of UniProt and (b) EMBL nucleotide sequence database. The database update is semi-automated with human checking and verification of the data to ensure the correctness of the data stored. The latest release SPdb release 3.2 contains 18,146 entries of which 2,584 entries are experimentally verified signal sequences with annotated references; the remaining 15,562 entries are either signal sequences that fail to meet our filtering criteria or entries that contain unverified or missing signal sequences.

Conclusions
SPdb is a manually curated database constructed to support the understanding and analysis of signal peptides. SPdb tracks the major updates of the two underlying primary databases thereby ensuring that its information remains up-to-date.

BMC Bioinformatics 2005, 6:249 doi:10.1186/1471-2105-6-249
Published 13 October 2005

一个有意思的密码管理方案

这个网站提供一种有意思的密码管理方案,让你在任何可以连上internet的终端,都可以用一个密码管理你的一大堆密码。但是有趣的是,他既不是把密码存储在服务器上,也不是存储在本地硬盘上。那么他是如何作到的呢?你可以去自己看看。http://passwordmaker.org/index.html
都是英文的,我还没有仔细研究明白呢。呵呵。

2005-10-15

浅谈BSP的选择

说到Blog,不免要说到用哪个BSP的服务的问题。

先说用虚拟主机空间。
虚拟主机的最大问题在于费用,如果你不在意,那么虚拟主机是最好的选择。
我一开始用的是收费的虚拟主机,网络条件非常好。我安装了著名的plog程序,PHP+MySQL的架构,功能非常强大,缺点就是太复杂了。用了几个月,换成了用文本数据库的Bo-Blog。这个也是国内非常流行的程序。
用了bo-blog一段时间,感觉模板做起来比较复杂,我也没有时间去看那些代码,而现成的模板太少,选择余地不大,恰好这时候看到了exblog的MSN风格的模板非常PP,于是禁不住诱惑,换成了exblog。 现在我的虚拟主机上还是exblog,可以到这里看看http://www.royalzhang.com

再说免费的BSP的服务。
国内的首先还是推荐Blogbus的服务,速度好,操作便捷,服务好。如果你有钱,还可以升级(去掉一块广告,提升空间等)。如果你是IT方面的人士,那就推荐donews的服务。我订阅了很多donews上的blog,非常不错。
至于bokee之类的不推荐。

国外的BSP首推google的blogger.com。最近google的公关不错,大陆把blogspot解封了。我也在主力blog安家在了blogspot( http://royalzhang.blogspot.com )。blogger的优点是没有任何广告,模板丰富且自定义方便。当然最大的风险还是说不定哪天又不能访问了。但是现在看来,以google在大陆的发展,再被封的可能性不大,否则李开复也太弱了。退一步说,就算被封,通过代理也可以上。
另外一个缺点是国外的BSP不方便教育网的同志们访问。这个问题的解决办法是利用国内的Feed服务。我现在用的是Feedsky的服务,订阅地址是 http://www.feedsky.com/feed/8844 。如果你用订阅服务阅读blog,那么订阅国内的feed就免去了国际网的连接。这样,也免去了被封锁的风险。

暂时写这么多,希望和大家交流。

从假"假赛"到真"假赛"------评孙福明重赛再败

10月13日的比赛,孙福明拱手让出冠军金牌,明眼人可以看出,这完全是孙福明的假"假赛"!

为什么这么说呢?

10月13日,孙福明赛后向记者表示:“没有让金牌的心理准备”。这表明,“假赛”的决定是赛前教练临时做出的安排,而孙福明只有委屈自己接受。但是,孙福明自己是想拼下这块金牌的。矛盾之下,孙福明觉得,既然让我假赛,那我就赛的更假一些,让大家都看出来,反正我是不得已的。而结果也正如孙福明所想,观众和网友都看出了这个明显的假摔,激起了热烈的讨论。从这一点上看,孙福明是尽了自己的全力的------不是尽全力比赛,而是尽力与假赛抗争的。这个结果是教练和某些领导始料未及的。正如某网友所说:孙福明完全可以在比赛中尽力比赛,而中途加装崴伤脚踝,被迫放弃比赛,这样观众都没话说。而孙福明没有这么做,一方面是和教练在赛前的仓促交待不详尽有关,另一方面也是孙福明的故意而为。

终于,在舆论的压力下,十运会组委会做出了处罚并安排了重赛。这一回,教练和领导就不可能犯同样的错误了。孙福明还是“最终”不敌小将,仍旧让出了金牌。这回,观众就没话了。在详密的安排下,孙福明不允许做出明显的假摔动作了,只有被迫真“假赛”了。孙福明的个人努力彻底失败。

在十运会这种成绩计算方法下,频频出现的假赛现象只能让国人更加失望。

背景材料:
北京时间10月15日下午14点15分,十运会女子柔道+78公斤级比赛的决赛在南京龙江体育馆进行了重赛。对阵双方分别是1996年奥运冠军孙福明和解放军队小将闫思睿。最终,小将闫思睿战胜孙福明取得冠军。十运会柔道比赛原本在10月13日就已经全部结束,但是在女子78公斤以上级的比赛中,辽宁选手孙福明遵从教练的安排在比赛中假摔,将金牌拱手让给了自己的小师妹。此事在媒体和百姓当中引起了强烈反响,10月14日晚,十运会组委会对这场富有争议的比赛作出了今日重赛的决定,并紧急召回了5名裁判和5名仲裁对这场比赛进行执法,同时对孙福明的教练刘永福予以了通报批评的处罚。

2005-10-08

一个域名为newYTHT的BBS

今天在一见如故BBS的一个帖子上才得知,有一个名叫newYTHT的BBS开张了。我去看了一眼,发现已经开张将近一个月了。版面开得不全,文章也没有多少,所以没什么可看的,就去sysop看了几眼。
这个newYTHT的BBS,很明显是模仿newSMTH.net,在YTHT的讨论区关闭后,借用YTHT的名字注册的域名。但是与newSMTH明显不同的是,newYTHT.net不敢像新水木那样公开叫做“新一塌糊涂”,只是叫着一个看上去很不正式的名字“我的BBS”。从sysop的文章来看,这个BBS好像是ID为nothing的人开设的,也没有迹象表明这个叫newYTHT的BBS继承了原YTHT的“衣钵”。
一开始我还看见lepton的ID发了很多帖子,但很快就发现此lepton非彼lepton,是不知名的网友注册了这个ID。不久,这个ID就被站务收回了,但是此ID的帖子还留在版面上。这也反应了开站初期的账号管理混乱。这一点不像一见如故BBS,一开始保留了原ytht的账号。因为这个newYTHT不可能持有原ytht的用户资料。
看来newYTHT只是和lqqm等bbs一样,只是利用了ytht的代码。希望他能继承一些ytht的传统,提供一个说话的地方。
此BBS可以通过http://www.newytht.com/或者http://www.newytht.net/访问,而用newytht.net/com还不能访问。在sysop已经有人提出这个问题了,但是某人的理由好像是“缺少技术站务”。域名解析是个很难的技术吗?搞不懂。