windows下如何安装bioperl

从以下地址下载activePerl的安装文件：
http://www.activestate.com/Products/ActivePerl/
下载后运行安装，所有选项默认即可，这样你的系统就有了perl环境了。
打开命令行窗口 (开始菜单->运行，输入“cmd”回车)，然后运行命令：ppm(C:\>ppm).

用以下命令，增加相应的软件仓库:

ppm> rep add Bioperl http://bioperl.org/DIST
ppm> rep add Kobes http://theoryx5.uwinnipeg.ca/ppms
ppm> rep add Bribes http://www.Bribes.org/perl/ppm

用下面的命令寻找bioperl:

ppm> search Bioperl

回车后系统将返回一些和bioperl相符的软件，并带有相应的数字编号如1、2、3

ppm> install

这里的就是你要安装的软件的编号。
好了，恭喜你，你已经安装好bioperl啦。
另外，你若使用数据库，默认的bioperl安装是不带数据库模块的，你只需要在ppm提示下，运行以下命令：
ppm> install DBI
ppm> install DBD-mysql
这里是安装了mysql的驱动模块，你若使用别的数据库，就安装别的，但是DBI是都需要的。
注释：这是在windows下安装perl和bioperl最简单、最方便的方法。你要是想挑战自己，你可以下载perl的源代码自己编译安装。我尝试过，编译成功了，也成功地编译了bioperl和其它的好多模块。但是DBD-mysql的编译始终过不去，因为缺少mysql.h文件。後来我发现，在windows下，这种从头编译的方式根本没有什么好处。于是还是安装了active perl。